Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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