Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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