Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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