Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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