Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms