Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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