Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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