Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms