Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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