Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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