Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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