Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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