Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms