Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms