Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP1P63208 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms