Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC4P56524 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms