Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms