Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA5P52803 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA5P52803 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms