Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRCA2P51587 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRCA2P51587 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms