Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms