Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms