Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCAMP43121 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCAMP43121 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCAMP43121 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCAMP43121 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCAMP43121 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCAMP43121 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCAMP43121 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms