Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms