Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms