Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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