Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMP3P12645 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMP3P12645 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMP3P12645 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP3P12645 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms