Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM228BP0C875 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms