Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3P05106 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3P05106 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3P05106 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms