Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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