Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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