Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVH48-1M5A8F1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms