Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms