Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms