Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms