Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms