Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms