Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms