Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms