Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms