Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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