Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms