Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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