Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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KLHL28Q9NXS3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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KLHL28Q9NXS3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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