Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms