Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms