Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PACSIN1Q9BY11 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms