Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms