Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms