Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms