Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms